Modélisation compartimentale
Objectifs
Décrire les principaux modèles compartimentaux en épidémiologie
Simuler des épidémies par des modèles Susceptible-Infectious-Removed (SIR)
Interpréter les différents paramètres pour le modèle SIR et ses dérivés afin de guider la prise de décision en matière de santé publique.
Traduire des hypothèses de propagation d’épidémies en système d’équations différentielles
Simuler des modèles stochastiques et représenter un comportement moyen
Simuler des stratégies de lutte contre les épidémies et mesurer leur efficacité
Plan
Contexte de la modélisation compartimentale. Définition d’une épidémie.
Modèle SIR déterministe
Calcul du taux de reproduction de base (R0)
Simulation d’épidémies
Exemples de données de surveillance épidémiologique
Exemples de modèles dérivés du modèle SIR.
Modèle SIR stochastique
Prérequis
Probabilité, statistique inférentielle, SAS, R (1A)
Régression linéaire, GLM, Modèle de durée, Calcul Bayésien, Méthodes de rééchantillonnage (2A)
Statistique des Processus, Epidémiologie (3A)